防堵傳統市場成防疫破口，經濟部6月6日宣布，將採取5大管制措施，包含擴大管制至周邊攤販，消費限制一小時，管制出入口，動員公所人力駐守查核，並加強流動攤販取締，另外各縣市相繼實施身分證尾號分流制度，以下統整各縣市相關措施：
台北市
北市傳統市場將以身分證字號尾數進行分流採買，單號為三、五、日，每週二、四、六則是雙號採買，週一至週五宣導民眾自主分流，週六、週日則採強制執行方式，違反規定者可開罰3千元至1萬5千元。
台北市市場處也提出「市場防疫提升計畫」，包括「容留管制、提前收市」兩項措施。從6月起公有零售市場實施容留管制，封閉部分出入口，朝單一出入口限縮分流管制為原則，場內以容留人數三分之二為上限，如人潮超過上限，則暫停開放民眾入場，販售生鮮食品的公有零售市場每日營業時間調整至下午4時完成收市。
新北市
新北市長侯友宜表示，要求168處市場各自提出人流控管計畫，落實人流管控、實聯制，市府會派員稽查，若無法管控就會勒令歇業。
宜蘭縣
宜蘭縣宣布傳統市場防疫指引，內容包括「全程佩戴口罩、落實實聯制、自主人潮分流採買」，分流採買原則上是一星期採買一次，一次購足，以身分證尾數單雙號分流採買，單號為每週一（上午）、三、五、日，雙號則是每週一（下午）、二、四、六。
基隆市
基隆市長林右昌呼籲自主市場分流，做不到將強制實行。針對傳統市場，依照身分證尾數「單號、雙號」自主分流採買，尾數單號、雙號的民眾，按照單日、雙日上市場採買（例如今日是8日，尾數0、2、4、6、8的民眾採買）。
桃園、新竹縣市、苗栗
由於桃園、新竹市、新竹縣、苗栗縣等四縣市來往緊密的生活圈，桃園市長鄭文燦、新竹縣長楊文科、新竹市長林智堅及苗栗縣長徐耀昌已達成共識，呼籲民眾到傳統市場採買要「按身分證字號尾數」單雙分流。身分證尾數單號者，星期三、五、日採買，尾數雙號則是星期二、四、六，也建議大家務必要「一次買足」，每周採買一次。
台中市
提出「市場分流運動」，包含分流採購、線上採購、一次買足、作伙宣導四大原則，按身分證字號尾數，單數於每周三、五、日，雙數於每周二、四、六分流採買，並持續要求各市場強化實聯制及進出人員配戴口罩、加強消毒頻率。
南投縣
除三級警戒防疫措施外，目前暫不實施「身分證尾號分流」措施。
彰化縣
除三級警戒防疫措施外，目前暫不實施「身分證尾號分流」措施，縣長王惠美則指出全縣傳統市場都採單一出入口、實聯制，外出不戴口罩將直接開罰。
雲林縣
大部分市場星期一公休，依照身分證最末碼，尾數單數的人於星期三、五、日採買，尾數雙數的人於星期二、四、六採買。
嘉義縣市
呼籲民眾盡量線上購買，實體採買者依身分證字號尾數分流，單數者每週三、五、日採買；雙數者二、四、六採買。
台南市
台南市117處公民營市場全面執行實聯制，市府也將統一提供外圍流動攤商QR Code，以納入管控。台南市市長黃偉哲呼籲，進入市場前若發現人潮太多，可另擇時間採買，做好自主保護，也能保護他人。
高雄市
身分證字號單數者每週三、五、日採買；雙數者每週二、四、六採買。若無法落實實聯制或人流管制、配戴口罩等，將暫停營業，6月1日起強力執法，市府要求所有菜市場必須遵守實聯制、戴口罩及人流分流三項防疫準則。
屏東縣
傳統市場分流升級，身分證尾數單數每週三、五、日採買；雙數二、四、六採買，公有市場租金、清潔費免收3個月，減少攤販負擔，規定傳統市場禁止試吃，一律外帶。
花蓮縣
菜市場入口處實聯制、量測體溫、酒精消毒以及總量管制等措施。且要求市場內滯留人數不可過於密集，要求市場內民眾保持室外1公尺社交距離，市場內禁內用、試吃。
台東縣
台東規畫「擴大管制區段」，須依身分證單雙號分流採買，台東縣財經處長盧協昌表示目前全縣唯一擴大管制區段的市場就是中央市場，假日分流管制，周六身分證尾數「雙數」可進出採買，周日改為「單數」。
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