國產疫苗被質疑保護力不明，價錢卻比國外疫苗貴上一截，但被譽為「冠狀病毒之父」的中研院院士賴明詔，就呼籲疫苗國產國造是必要的，因為疫苗現在如同戰備物資，跟軍購一樣重要。台大醫師李秉穎也認為，未來病毒可能變異，不能只仰賴國外進口。

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捍衛國產疫苗，衛福部長陳時中炮火全開，因為國產疫苗不管高端還是聯亞，價格700、800元，都比輝瑞、莫德納、BNT貴上一截，又因為3期試驗還沒做，保護力未知，受到國內輿論質疑。但疫情戰戰況多變，疫苗宛如戰備物資，綜觀亞洲，日韓也都在加速研發國產疫苗。

台大醫師李秉穎強調，「疫苗有國產國造的必要性，如果只做代工，恐怕面臨代工大國印度窘境，無論國內疫情多嚴峻，疫苗只能以出口為主。」

但以台灣目前狀況，要組成疫苗國家隊，恐怕困難重重，因為以國內幾條疫苗供應鏈來說，國光生技官股的持股比重，不到16%；台康生技雖然目前有19.4%，但在鴻海創辦人郭台銘砸50億入主後，官股被稀釋，也將喪失主導權；至於高端，去年（2020年）1月曾邀國發基金入股，但國發基金作業繁雜，意願也不高，失去機會。被譽為「冠狀病毒之父」的中研院院士賴明詔就呼籲，政府應該加大支持國衛院疫苗廠，投資疫苗如同軍購。