6月27日開始，入境台灣的旅客，一律要在防疫旅館隔離14天，不能居家檢疫，讓不少民眾抱怨不合理，前國民黨立委羅淑蕾就認為，如果已經打了兩劑疫苗、PCR檢測也是陰性，染疫風險低，為什麼一定得去住防疫旅館？指揮官陳時中強調，雖然不方便，但疫情要控制，邊境必須管制，未來會視狀況滾動式修正。

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機場工作人員再三宣導，6月27日起，入境台灣得到防疫旅館住14天，不能居家隔離！政策引發討論，近期因為工作到美國的前國民黨立委羅淑蕾，就認為不合理。

羅淑蕾質疑，「人家打了疫苗，保護力已經90%幾了，上飛機前又有PCR檢驗，下飛機你再給他檢驗一次嘛，他檢驗又是陰性的，你就讓他回家居家隔離，為什麼一定要住防疫旅館，你知道現在防疫旅館一館難求，而且防疫旅館趁機漲價。」

疫情指揮中心副指揮官陳宗彥表示，「全國的防疫旅館入住率32.26%，目前還可以使用的房間，絕對不會有不足」，指揮中心澄清防疫旅館絕對夠，但的確會讓民眾多一筆開銷。

羅淑蕾建議，依照風險高低，彈性處理，其實現在各國入境規定都不同，以美國來說，如果已經完成疫苗接種，入境免隔離，未完成者必須居家隔離7天；英國則是照國籍不同，分為紅黃綠三種燈號，綠燈區來的免隔離，像台灣屬於黃燈，得居家隔離，從紅燈區入境，必須在指定旅館隔離；日本規定較嚴格，入境後一律採檢，並且要居家檢疫14天；韓國則是從7月1日起，完成疫苗接種者，入境不用隔離。