根據司法院公報,在98年度鑑字第11500號懲戒議決書指出,張亞中曾與一名女子陷入糾紛,內文包括「該女控訴遭教授張亞中剃陰毛性侵,但沒告成,並稱張亞中利用教職性侵兩名女學生,基於檢察官之職責,為查此重大性侵害案件,始與該女保持聯繫,希望能找出被害之女學生」。根據NOWnews今日新聞報導,指出有該校教務人員透露,張亞中在任教期間,有數名女學生要求更換指導教授,更有女學生家屬打電話到校園,多次抗議張破壞家庭的紀錄。
針對上述指控,張亞中在19日前往台中鎮瀾宮參拜結束後,回應「該女所言並無任何證據,校方不可能、也不會容許發生這種事情」;強調一切均為子虛烏有,也說明自己「沒有婚外情」,同時在現場痛批自己的對手「選舉到了不要丟黑函、放假話,不要這麼邪惡」。
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