台北市長蔣萬安參與二二八紀念活動。（圖／民視新聞網）「二二八國家紀念館」在臉書發文澄清，為了避免大家誤會，因此來幫蔣市長「補充」說明，台北市長蔣萬安的致詞稿中提到「身為台北市長，我深深為76年前發生在台北市大稻埕天馬茶房附近的緝菸事件，進而導致全台二二八事件的歷史傷痛，致上誠摯的歉意」，此一說法被「二二八國家紀念館」糾正，因為天馬茶房緝菸事件並非為引發二二八事件的主因。
「二二八國家紀念館」指出，有關二二八事件發生的背景及其原因相當錯綜複雜。也歸類出幾項事件讓人民積怨已久，才造成二二八事件的爆發。
一、長官公署體制的特殊化。
由於行政長官擁有行政、立法、司法，甚至人事、監督之權，因此形成在臺專權獨斷的權力，再加上兼任台灣全省警備總司令，更形成軍政一元集權的特殊化，無怪乎當此體制頒布後，許多台籍人士均大失所望。其體制在台灣實施期間，不斷有人建議國府高層廢除長官公署，恢復省府制度。
二、政治壟斷與接收弊端。
當時中國大陸人士壟斷政府重要中高級職位，以及所產生各種牽親引戚、營私舞弊、貪贓枉法等接收弊端亦是二二八事件的重要原因。
三、經濟統制與民生困苦。
陳儀及其接收集團採取的是經濟統制政策，也就是物資管制、金融壟斷、物品專賣，然而其後果卻造成民眾失業與飢餓的民生困苦之狀。
四、社會動盪與文化隔閡。
由於部份來台軍警紀律敗壞、作威作福，再加上與台灣民眾的文化隔閡，造成彼此間的衝突對立，使得社會治安惡化，騷亂事件層出不窮。
1947年2月27日下午，天馬茶房緝菸事件是人民積怨已久、引爆民怨反彈的導火線。天馬茶房緝菸事件在台北爆發後，各種反抗行動或是衝突事件陸續不斷在全台各地發生。大部分的反抗行動多為反對官署的腐敗，進而包圍佔領地方機關單位，有毆傷人員或是接收警察局、派出所、兵營軍火庫武器及物資等情形；另外也有許多因省籍的怨恨而引發的街頭流血事件衝突。
在反抗行動與衝突爆發後，政府隨即展開一連串的鎮壓與整肅行動。高雄市由於當時駐軍兵力頗多，因此雖有民眾反抗行動，但未獲得官方正面回應，反遭受強硬的軍事鎮壓，成為二二八事件當中，最為悲慘且血腥的受害地區。
陳儀在1947年3月2日發出的「寅冬亥親電」，當時的行政長官陳儀電報蔣介石，請國防部參謀總長陳誠，迅速調素質優良之步兵來台，陳儀電文提到「至少先派一團來台，俾可肅清奸匪以紓鈞座南顧之憂」。而蔣介石在3日後的3月5日派兵手諭回覆陳儀，「已派步兵一團、並派憲兵一營，限本月7日由滬啟運，勿念。中正」。
3月8日，蔣介石派兵的整編第廿一師抵台在基隆登陸，陳儀隨即宣佈全台戒嚴，各地自此進入恐怖捕殺時期。在全臺及澎湖地區大規模實施所謂「綏靖」與「清鄉」工作過程中，由於各地抗爭武力皆屬臨時組成毫無訓練，加上反抗勢力分散，單薄的武力實不足以對抗裝備精良的正規軍隊，因此整個「綏靖」計畫除於中南部曾遭受短暫抵抗之外，其餘各地皆如期完成。
惟「綏靖」、「清鄉」期間，各地傳出不少地方人士因個人恩怨或派系糾葛，而遭人恐嚇勒索、密函陷害或報復暗殺；也有不少民眾在軍警鎮壓掃蕩時，被無辜濫殺而淪為槍下亡魂。二二八事件不僅有2月27日天馬茶房緝菸事件，還有2月28日行政長官公署開槍事件、3月6日高雄大屠殺、3月8日基隆大屠殺、3月11日八堵車站事件、3月嘉義車站前談判和平使槍殺。
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