選舉前，不斷模擬投票當天動線，但指揮中心推估，11月26日當天可能7萬人，因為確診隔離無法出門投票，前疾管局副局長就擔心會有人確診違法外出投票，導致疫情擴散。
前疾管局副局長施文儀說，「最近會開始下降，很顯然的大家為了要去投票，很多人會投機取巧啦，這個可想而知啦，本來投票的風險就高，然後再加上黑數增加，風險會更高，一定要把自己做很好的，評估跟保護才去投票，不然等於是投閻羅王一票。」
前疾管局副局長施文儀所說的高風險族群，包含慢性病、免疫不全或是老人小孩等等，還列出沒打滿3劑、最近一劑疫苗非次世代，以及3個月沒確診過的民眾要特別當心。
但公衛專家陳秀熙就樂觀許多，認為投票比起跨年活動相對安全。
台大公衛系教授陳秀熙說，「選舉是一個有秩序的活動，可以在口罩跟社交距離的克服之下，大家常態，以正常的方式出來投票，我們就是在這一天，大家能夠發揮防疫文明，把口罩跟社交距離做出來，然後投票完之後盡量不要待太久。」
整合醫學專科醫師姜冠宇表示，「事前要看選舉公報，知道自己要投給誰，這樣現場才能夠說投的乾淨俐落，趕快投完趕快閃。」
不少醫師都提出建議，避免長時間待在投開票場所，也要做好個人防疫，高風險族群要格外注意健康狀況，正面看待有秩序的投票活動！
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