13日一早，總統蔡英文、行政院長陳建仁，以及台南市長黃偉哲等人，皆親自出席星雲大師的圓寂讚頌典禮，現場也湧入超過5萬名信眾送大師最後一程，場面相當莊嚴隆重。同時，總統蔡英文也親自頒發褒揚令，表彰大師弘揚人間佛教的卓越貢獻，高雄市長陳其邁則頒發高雄市榮譽市民證書，由心保和尚代表受贈。典禮結束後，僧信二眾夾道跪送星雲大師的法體真身坐龕，車隊巡禮佛光山1圈，歷時約1個半小時後，由警車開道以及3名住持和長老護持大師靈車，前往台南大仙寺進行荼毘儀式。
13日一早湧入逾5萬多名信眾出席星雲大師的圓寂讚頌典禮，送大師最後一程。（圖／民視新聞）經過3小時的荼毘儀式後，佛光山證實，弟子們為星雲大師整理舍利靈骨時，發現有數顆清淨白皙、光滑圓潤，形狀宛如珍珠般大小的圓形結晶舍利子，「數量目前都難以計算，令人震驚。」至於星雲大師先前為何直言「我沒有舍利子」，並指出過去出版365冊的星雲大師全集，才是大師的法身舍利子？佛光山也解釋了。
星雲大師舍利子色澤多為法乳般淨白，還有少數紅、黃、藍、黑等琉璃光色的圓形結晶狀。（圖／佛光山提供）佛光山提到，這是因為星雲大師認為「不必強調舍利子的信仰」，希望世人對佛法的認知應回到根本，而不是在有形、有相上求。同時也提到，一如大師曾說過，只有道德才是取之不盡，用之不竭的寶藏；能夠求證空無的真理，更是究竟解脫之道。而星雲大師的真身舍利，應證了人間佛教的菩薩行者，以慈悲智慧在人間為眾生服務、落實三好、四給的行持，也是至高無上的法門。
星雲大師的圓形結晶舍利子，有部分出現在潔白的遺骨舍利中。（圖／佛光山提供）佛光山表示，除了真身舍利外，星雲大師一生的行誼、法語開示以及文字著作，如395本《星雲大師全集》等都是他的法身舍利，若能閱讀後，提升自我道德修養，身體力行，才是真正平安幸福的解脫道。
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