英雄落難？2021年4月起，全台疫情爆發，之後進入三級警戒；2022年4月，Omicron變種病毒又捲土重來，均造成醫療機構巨大負擔；當時為補償第一線醫護人員的犧牲奉獻，政府承諾將發放額外的「防疫津貼」以為表彰。
沒想到事過境遷，竟傳出「衛福部帶頭霸凌防疫專責醫院」的爭議；臺北市立聯合醫院企業工會，今（10）日上午在和平醫院門口發起抗議，批評衛福部不僅遲未發放約好的防疫津貼，竟還反過來向和平院區追討過去已經發放的752萬元津貼。
工會理事吳承恩表示，被衛福部追討的752萬津貼期間，就是2021年4月至2022年4月期間，北市萬華區疫情爆發的時間點；鄰近萬華的和平院區首當其衝，海量病患湧入；醫護救人都來不及，因此當時依照疾管署指示「節省行政量能」，不再通報「疑似病例」。
未料疫情高峰過去後，醫事司回頭審查防疫津貼時，反過來堅持疑似病例若沒完成「法定傳染疾病系統」登錄與通報，便無法證明醫療人員確實進行防疫任務，因此拒絕津貼補助。
接到醫事司意見後，北市聯醫連夜趕工，在系統上補通報4,000筆疑似病例，疾管署一方卻拒絕受理！並說明該署早已發出多封公文給醫事司，告知醫事司自行進行疑似病例審查，勿再使用「法定傳染疾病系統」作為發放津貼的依據。
吳承恩痛批，醫事司與疾管署均為衛福部單位，卻互踢皮球，踐踏第一線防疫醫療人員的辛勞，將北市聯醫與醫療人員耍得團團轉；衛福部作為醫事司與疾管署的上級主管機關，至今仍躲在幕後、默不作聲，不僅未出面解決問題，反而還向醫護人員追討過去已經發放的752萬元，根本是「帶頭霸凌醫院」。
對此，衛福部發布新聞稿回應：自2020年1月至2023年4月，已撥給和平院區4億2,641萬2,000元；爭議的752萬元，是經衛福部審查後，減列不符資格之防疫費用；這752萬元已經進入覆審程序，如確認符合資格，也將核實撥付。
但這樣的回應，北市聯醫工會並不買帳，批評衛福部「牛頭不對馬嘴」；工會所指出「法定傳染疾病」系統不收疑似病例的問題，以及醫事司、疾管署雙方互踢皮球，導致醫院準備完整資料卻無處通報，致使醫療津貼被追繳等問題均「毫無回應」；工會呼籲衛福部本部儘速出面解決爭議，「停止追殺醫療人員！」
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