行政院長陳建仁今率部會首長赴立法院進行年度中央政府總預算編製報告及備詢，邱國正在會前接受媒體聯訪時對於潛艦洩密案表示，大家都很盡責，黃曙光很盡責、工作也很認真，幾個立委也經常碰面，「問政本來就是他們工作，備詢也我們責任，好事一樁，沒想到弄到這地步真的不樂見，希望很平和發展下去」。
至於馬文君被質疑沒簽保密協議，邱國正指出，機密資料擺在那邊去看了一定會簽名，在立法院秘密會議也會簽名，但涵義有點像是告知要保密，「沒有一張紙是保密協定」，國防部開會有單子要簽保密切結，但立法院好像沒有這樣做，就是簽名代表。
邱國正說，國防部開會都有約束，不能說捕風捉影、講話不經意，但發展到人家揣測、專家的見解也都尊重，不會進行辯解為每個人論點和看法都尊重。邱國正指出，有跟黃曙光談到，的確壓力很大，「但他沒有指明哪一個人」。邱國正強調，會有一些困難，但都是談論如何克服困難，沒有去對任何人做評論。
邱國正還提及，馬文君一直在質詢，去年年初的確有交一份資料給軍方，所以軍方研判後有派人去跟馬文君說明。邱國正強調，「沒有揣測哪個人好像洩了密，哪個人冤枉，一切法來作界定，比較公平」，眾說紛紜希望平和落幕。
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