中選會說明，全國性公民投票電子連署系統上線後，民眾如要連署全國性公民投票案，可透過提案人之領銜人提供的網址進入電子連署系統，該系統操作介面簡單方便，民眾只要使用自然人憑證，並輸入國民身分證統一編號、憑證Pin碼，按下「我要連署」鍵，就能完成連署。
中選會也表示，為避免連署人資料遭洩漏、竄改及確保系統資安無虞，自2019年起依前行政院資通安全處、數位發展部資通安全署7度稽核該會之資安項目及稽核結果，辦理系統資安強化措施。鑑於行政院資通安全稽核事項及系統上線整備作業均已完成，並考量宣導時程之需，全國性公民投票電子連署及查對作業辦法施行日期、全國性公民投票電子連署系統上線日期定於2024年4月10 日。
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