反對黨領袖奧汀加（Raila Odinga）宣稱總統大選電子投票的結果遭到駭客入侵，並且遭到操控，以讓選情對總統甘耶達有利（Uhuru Kenyatta）。
本次選舉中，甘耶達本來以54％的得票率得以連任，而奧汀加在2013年時也曾向法院控告大選結果不公，但當時被判敗訴。人權團體表示在8月8日的選舉結果公布後，已有至少24人於抗爭活動中被警方殺害。
肯亞的選委會表示，曾有人試圖駭入投票系統中，但並未成功，而人們對本次投票的不信任，可能與大選前幾日時，主掌電子投票系統的資訊科技主管穆桑多（Chris Msando）遭到殺害棄屍有關。
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