教育部長人事案公佈隔天，藍營立刻群起圍攻，中央黨部、立院黨團分頭開記者會，砲轟準教育部長吳茂昆。
黨中央秀出資料，2010年4月，吳茂昆的名字出現在中國高等科學技術中心顧問職位，這個中心還是中國財政部支持，質疑他受中國政府資助，接著再批2016年蔡政府上台後，吳茂昆也是「中國高能物理研究所」的顧問。
國民黨發言人洪孟楷指出，「吳茂昆過去在對岸擔任官方資助的中國高等科學技術中心，顧問委員會委員，甚至橫跨吳茂昆先生，擔任東華大學校長的期間。」
立院黨團書記長李彥秀更爆料，「吳茂昆在擔任東華校長期間，有諸多的爭議，包括校內週刊報導，設立建設公司，溢領相關的獎助學金等等，還曾經還被監察院糾正。」
藍營列出吳茂昆曾經到中國多間大學開講座，擔任中國國科院顧問，更在東華大學校長任內，接連爆發溢領獎助金176萬、掏空校務基金、成立建設公司炒地皮等負面傳聞，時代力量立委徐永明也加碼，要求吳茂昆站出來回應，釐清個人爭議再上台。
民進黨立委趙天麟也認為，如果吳茂昆違法兼職、違法擔任顧問，當然不適合擔任教育部長，而且還必須依法論處。
還沒上任，就爆出一堆爭議，綠營呼籲吳茂昆親自面對講清楚，預計下週立院教育委員會也會邀請吳茂昆對教育部業務專案報告，屆時藍營更會用最嚴格標準檢視新任教育部長。
（民視新聞／林嘉玫、張育睿、周寧、陳威余 台北報導）
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