日本直到目前已超過33萬人感染武漢肺炎，除了各地不斷爆發群聚疫情外，在靜岡縣甚至傳出有3名沒有出國史的民眾，確診染上英國變異病毒的案例。而日本預計最快從2月下旬起開始施打疫苗，日相菅義偉則指派行政改革大臣河野太郎，負責統籌接種事宜。

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1月18日晚間，厚生勞動省緊急召開記者會，宣布靜岡縣有3位民眾染上英國變種病毒，而3人皆沒有英國旅遊史，還有2人感染途徑不明，因此官方也懷疑可能是在國內發生的社區感染，對此展開進一步調查。

靜岡縣記者會提到，「考量到在新年前後，全國染疫人數都明顯上升的情況，或許變異病毒在進入國內後，已經開始在某些地區擴散了也說不定。」除了變異病毒虎視眈眈，日本各地爆發的群聚疫情，也不斷對各地醫療體系，帶來沉重壓力。

NHK主播報導，「神奈川的橫濱監獄又新發現，有50名管理人員和受刑者染疫，千葉縣當地的縣立高中，和老人院也都爆發群聚感染，而東京杉並區的2間醫院，也都發生規模40~50人的群聚疫情。」染疫人數持續上升的茨城和沖繩等地，也先後表示要自行宣布進入區域緊急狀態，嚴防疫情擴大。而日本先前表示，最快將從2月下旬起全面施打疫苗，日相菅義偉也在18日任命行政改革大臣河野太郎，兼任疫苗大臣，負責統籌接種事宜。