鄭文燦表示，他就讀在職專班是為了要拓展個人的視野，於2003年進入台大國發所的在職專班，當時基於對中國民主化的議題比較關切，因此選擇了中國基層民主演進的研究主題，受限於時空條件，沒辦法做實證研究，所以採取了文獻分析法，引述很多書籍、期刊或網路上的文章等等，大概超過100多篇。
鄭文燦說，論文口試時，三位口試委員包含了周繼祥所長、陳明通及林佳龍，三位根據鄭的問題意識，包含研究的架構、研究的原創發現等等，通過了論文的審查。當時的國發所並未要求做相似性軟體的比對，沒有這樣的標準，當時也沒有流行論文比對軟體。
鄭文燦指出，經過了10幾年，現在學倫會是根據檢舉用相似性比對的軟體，找出了一部分未引述的論文來源，如果當時有做比對，他當然會把附註跟參考論文都填上去。「我想這是基本的道理」，所以在學倫會的出席時，特別針對這點的寫作瑕疵做說明。
鄭文燦提到，瑕疵形成的原因是當時的時間較短，或者資料較多，所以有些引述的論文來源沒有做附註，這不是抄襲單一篇論文形成的，也沒有抄襲的意圖，因次當時在書面及口頭，都向學倫會致歉。
鄭文燦解釋，學倫會的審定能有不同處分，包括公開道歉，或限期更正，或其他的撤銷的處分等，不管學倫會做什麼處分，他大學及研究所都是就讀台大，當時報考國發所也是希望能夠進修，提升視野，基於這樣的出法點，對台大及國發所都是感謝的，因此會坦然面對審議結果，也會與大家再表達歉意。
鄭文燦提到，寫作瑕疵未來包含在職專班的碩士論文，將來是否要建立相同的標準，包含論文的相似性比對等，有待以後由大學自己來討論檢討，學倫的審議機制也是一樣，現在是由院長邀集5至7人，以不具名的方式進行審查，將來針對學倫的分級審議，這部分也應該是由大學自己來做討論，站在他的立場，會坦然面對學倫會審議的結果。
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