根據慈濟大學、慈濟科大在官方網頁的合校專區資訊，兩校引述教育部資料指出，未來11年內，台灣平均每年減少1.1萬名學生，慈濟2校在生員方面，兩校系所的學生數未達經濟規模，仰賴慈濟基金會支持比例高；另在學術方面，兩校規模太小難以形成大型研究團隊，還面臨國立大學的師資挖角而留才不易。因此必須做出併校的決定。
據公告資訊，目前慈濟大學學生約3,400人，慈濟科大學生約3,200人，為提升教職員更高的教育品質，兩校規劃合併工作的期程，將於今年1月開始遴選合校後的校長，今年8月讓兩校正式合併，並於一年內修定組織規程，讓新任校長上任整合教學資源，深化研究成果。
兩校提到，慈濟科大源自於民國78年成立的「慈濟護理專科學校」，慈濟大學源自於民國83年成立的「慈濟醫學院」。未來慈濟的大學2間大學合併後，作為東部唯一的醫療教育機構，會更專注在長照與醫療相關系所發展，並計畫向教育部增設牙醫系、臨床藥學系以及學士後中醫碩士班。
兩校表示，合併後的「慈濟大學」，仍以「慈悲喜捨」為校訓，為社會培育具備「尊重生命，以人為本」的優秀人才，配合國家高等教育國際競爭力政策，加強與慈濟四大志業（慈善、醫療、教育、人文）鏈結，填補城鄉教育資源與機會的不平衡現象，成為一所具有實踐力與影響力的典範大學。
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