法務部長蔡清祥說，「這個問題由權責的台中監獄，在依法處理當中，靜待台中監獄查證的結果，呈報給矯正署，這不是敢不敢的問題，而是有沒有依法來處理，我相信台中監獄一定會審慎，來依法處理，對於他目前有沒有遵守保外就醫的規定，台中監獄它本於權責就會處理，都在調查當中，上級機關矯正署也會緊盯這件事。」
陳水扁當天不但到總統府前遞交請願書，後續又到行政院與立法院，並兩度受訪。過程中有持拐杖輔助，但精神看來不錯。由於當初矯正署核准他保外就醫，還有要求遵守「五不原則」。法務部已責成矯正署督導台中監獄進行了解，依照所蒐集的事證判斷有無違反相關規定。
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