國發基金投資樂迦及三顧分別2.79億元及1.15億元，加上泛官股共持有38%股權，理應掌握樂迦董事會，但根據經濟部公開資料，樂迦9席董事中，國發基金僅派任1席，三顧7席董事，國發基金也只派任1席。反觀三顧僅持有樂迦15%股份卻掌握4席董事及董事長。
另從三顧及樂迦董事席次，顯示三顧副董事長陳宗基掌握2家公司，陳對外宣稱募資能力強大，成功掌握營運及資金後，經常出席國發基金、經濟部的活動與政黨人士合照，宣稱和許多政商界人士很熟，但兩家公司近年卻連續出現虧損，其中三顧今年第一季每股虧損0.37元，已相當於去年一整年的虧損，引發投資人不滿，並質疑國發會未善盡監督之責。
如今隨著楊智惠去年9月請辭樂迦執行長的辭任書曝光，外界才得以一窺該公司治理疑遭董事不當干預的問題。
根據楊智惠的辭任書，她直接點出有董事為自身利益，以不合理及不依據法規制度強勢干預公司治理，導致法務、人資、資訊及開發部門重要幹部相繼請辭，甚至有同仁辭職聲明直言董事干預讓他們身心俱疲，何以能容許個人挾權勢霸凌專業？
楊智惠還在辭任書中明白指出，三顧要求掌控樂迦，某董事提言動用樂迦董事會的三顧法人代表董事群將她解任；單一董事嚴重干預人事、財務、採購、技術發展，她任何反對都無法制止這些不合理且違背IPO公司治理各項專業與規範原則的要求，因此決定辭職，期盼其他董事能捍衛樂迦全體股東最大利益。
今年6月30日，樂迦公告撤換陳宗基的董事職務，由三顧改派法人代表楊瀅臻。但樂迦離職員工透露，美女教授楊瀅臻也是三顧副董事長陳宗基的好友，甚至在去年6月欲聘為樂迦的顧問，還衍生人資部吳姓副理辭職風波。
依據吳姓副理在樂迦的離職理由載明：「樂迦公司高層介入多起顧問及員工之聘用，楊澄臻老師之顧問聘用案，職一切依規定辦理，卻歷經長官責難，甚至要求向其道歉。長官暗示要看風向，完全顛覆本人對樂迦公司治理之期待，以及本人對主管機關內稽內控之理解範疇，為免耽誤長官們有其需達成的目標，自請離職。」
由於國發基金是三顧和樂迦公司的大股東，兩家公司治理若出現重大瑕疵，主管機關有必要表達關切，甚至介入輔導，以免衍生更大的弊端。
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