颱風過境，台南市的海岸線到處堆滿垃圾，而且大多是寶特瓶、保麗龍等廢棄物，讓美麗的海岸線全部變了調，從北到南幾乎都是髒亂一片。
台南社大研究員晁瑞光表示，「在四鯤鯓北邊安平港南堤這裡，還有包括像七股潟湖北堤最北邊那裡，這些垃圾的量非常嚇人。」
台南社大調查發現，「杜蘇芮」颱風來襲前，海岸線就陸續有垃圾漂到沙灘、防風林及消波塊處，颱風過後問題更是嚴重。
台南社大研究員晁瑞光表示，「8月5日颱風一開始是吹東南風，所以它把很多過去，比較零散在一些地方的，全部都聚集來。」
台南市的沙灘被海漂垃圾攻佔，光靠志工是不夠的，台南市環保局統計，從7月1日迄今，已合計清理出200多噸廢棄物，但還是清不完。
台南市環保局科長潘寶淑表示，「主要是以蚵架、保麗龍、寶特瓶居多，環保局也通知開口契約，來協力清除整個海漂垃圾。」
台南市的海岸線長達68公里，分屬11個權責單位管理，市府未來將定期操作無人機巡查海岸外，也呼籲各單位盡速將權責區清理乾淨。
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