農業部指出，各國進口雞蛋均依我國衛生及檢疫規定辦理進口，輸入雞蛋須檢附出口國官方衛生證明文件，除須符合我國檢疫規定外，輸入時食藥署也會逐批抽驗，合格者才可通關放行。農業部強調，抽驗不合格者退運或銷毀，退運銷毀費用由業者自行吸收，不會由全民買單，更不會進到國內販售，食安皆有把關，請消費者安心，也請外界勿散播不實訊息。
農業部說明，從巴西進口雞蛋巴西是全球雞蛋主要輸出國，日本、新加坡、中東都有從巴西進口，日本更每個月從巴西進口一千三百萬顆以上雞蛋，巴西雞蛋品質受到許多重視食安國家的肯定。
針對外界質疑是因為品質有疑慮才沒有續訂巴西雞蛋，農業部表示，雞蛋專案進口的所有訂單會視國內雞蛋供需以及國內安全庫存量而定，優先考量國內雞蛋產量是否能自給自足；若有缺口，所有符合檢疫及衞生規定的各專案進口國雞蛋，皆會依既有原則規劃下訂。
農業部也強調，巴西進口雞蛋檢驗不合格率僅1.57%，138.24萬顆檢驗未通過雞蛋將全數銷毀，絕不會進到國內販售。
陳吉仲今受訪時針對國民黨民代的批評，他認為這樣的指控完全不專業、完全誤導，扭曲對消費者權益有幫助的政策。陳吉仲說明，所有的雞蛋專案進口，衛福部食藥署在邊境會進行相關抽驗，只要有不合格，不是退運就是銷毀，有問題的進口蛋不會進入到國內市場。
陳吉仲也期待，外界在檢視雞蛋專案進口案時，應檢視是否有有達到相關的成效，不要再傳遞錯誤的訊息、或是故意抹黑扭曲；若再不實指控進口雞蛋有食安問題或有圖利等，農業部將進行提告。
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