由於日本石川縣外海，稍早發生地震與海嘯，以能登半島為中心，周邊各項交通設施也多數中斷；據日媒《NHK》報導，新潟空港已經宣布，今天後續所有從該機場出發、以及原訂飛抵機場的航班「全部取消」；另外能登機場、小松機場與庄內機場，目前已取消24相關航班，且各航空公司預計還會取消更多航班。
新幹線方面，北陸新幹線震後一度全線停運，目前恢復「東京─長野」間的列車營運；上越新幹線「越後湯澤─新潟」間停止營運；東海道新幹線「新大阪站」周邊路段，也有部分誤點與停駛情況。至於東北新幹線與秋田新幹線，則恢復正常運行。
道路交通方面，北陸高速公路、上信越高速公路、關越高速公路、東海北陸高速公路、磐越高速公路、日本海東北道等，均宣布部分路段、或全線禁止通行；國道8號多處損壞、249號隧道也因山崩無法通行；超過3.3萬石川與新潟民宅停電；日本海上自衛隊已經緊急派出偵察機，飛往災區蒐集更多資訊。
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