財團法人台灣民主基金會更新董事會名單政黨代表比例，民進黨、國民黨、民眾黨席次比例從5、4、1改為4、4、1，退出者為前民進黨立委羅致政。外界質疑，羅致政突然被拿掉是因為遭國民黨不斷打壓，國民黨則反咬民進黨想要掌握民主基金會的利益，並質疑民進黨卡立法院長韓國瑜擔任民主基金會董事長。
對此，吳思瑤回應，完全沒有聽聞這樣的訊息，這樣的說法完全是空穴來風，「我們沒有辦法針對一再空穴來風的謠言進行評論」。民進黨是依民主基金會章程及慣例進行後續改組，其運作方針及成立宗旨是，深化台灣跟民主同盟國家之間的國際合作跟交流。
吳思瑤指出，但這段時間卻發現，國民黨在申請民主基金會的政黨補助上，完全違法規定，一再被踢爆國民黨這幾年拿超過500萬元補助款去訪問中國，請問中國是民主國家嗎？而國民黨副主席夏立言頻繁訪中，是否用到民主基金會的補助？
吳思瑤強調，民主基金會是要強化跟民主同盟國的合作交流，國民黨卻一再申請外訪計畫前往中國，又譬如國民黨居然大辣辣申請經費經營自家網站，將網站從中文翻譯為英文，「國民黨沒有英語人才嗎？」動用國家補助的珍貴資源作為一黨的網站經營與翻譯工作，顯然社會也難以接受。
吳思瑤指出，國民黨還拿補助去做民調，是不是做自己政黨選舉相關的民調？如果要抽絲剝繭，沒有比較沒有傷害，國民黨自己濫用民主基金會的補助經費，用在顯然不符合宗旨、原始功能設定用途的地方，這才應當是社會要加以撻伐。
吳思瑤呼籲，國民黨立委們要好好檢視自己，立委也肩負監督預算的職責，國民黨立委可以接受這樣預算被如此不當挪用？
此外，針對韓國瑜證實找政大教授盧業中擔任民主基金會執行長一事，吳思瑤表示，民主基金會依慣例，未來執行長人選，應當是總統有相當大的任命權利，這是依慣例，尊重現在正在改組的民主基金會，不管是董事派任乃至於執行長的任命，希望都能維持慣例，推選出各方可以接受的人選。
吳思瑤認為，最重要的是，民主基金會的原始宗旨是強化跟世界民主國家的合作跟交流，希望未來的新任民主基金會，要在正確的台灣路線上前進。
另，韓國瑜提醒立法院各官員要潔身自愛，還搬出《鹿鼎記》比喻，希望大家小心用人，甚至要求大家要提出書面報告？怎麼看這件事？
吳思瑤說，新人新氣象，韓國瑜要大力精進立法院各處室人力管理，讓立法院組織能夠發揮正向功能，協助國會專業問政，這本來就是院長重要職務，所以院長要好好檢視，提升各處室功能，「我們當然樂見其成」，也期待立法院在各方面大家都能往高品質國會方向前進。
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