駐日代表李逸洋拒絕出席典禮，改由駐福岡辦事處處長陳銘俊代表參加，並痛批長崎市政府「完全無視台灣的主權及尊嚴」。（圖／翻攝自李逸洋@臉書）駐日代表李逸洋於個人經營臉書發布貼文，說明自己未於9日出席長崎和平紀念典禮的原因，原因就是長崎市政府將台灣代表座位安排於使節團區域外，「刻意矮化台灣國格與地位，因此改由福岡分處陳銘俊處長代表參加。」，李逸洋認為台灣追求和平、熱愛民主舉世皆知，81年前的廣島、長崎原爆，許多台灣人也是受害者，台灣深刻承受二次世界大戰的悲慘，希望透過參加和平紀念典禮宣示追求和平的決心，並與民主國家共同付諸努力，不過他遺憾「可惜長崎市政府態度親中，去年台灣珍惜首次有機會藉和平典禮向世界宣示堅守和平決心，忍辱出席，但會後立即發表聲明抗議對我不公待遇。」，並表示接下來一年，有許多友我重量級國會議員多次出面向長崎市政府力爭，福岡辦事處也透過地方議員及民間團體努力，遺憾對方仍未給予台灣正確待遇，因此台灣也降低層級出席。
日本長崎原爆和平紀念典我方改由福岡分處陳銘俊處長代表參加。（圖／外交部提供）面對在典禮席次安排上，長崎市政府刻意否定台灣的國家地位，讓李逸洋控訴「完全無視台灣的主權及尊嚴」，這種情況是多年來台灣在日本參加各項中央或地方活動，所未曾有過的遭遇，他認為長崎市政府不知其錯誤決策已成為中國對台實施法律戰，也就是「台灣非國家、無主權，是中國的一部分」的執行工具，李逸洋也強調「台灣是主權完整獨立國家，與中國互不隸屬，中國未曾一天統治台灣，台灣的中華民國建國早於中國，台灣從來不是中國的一部分。」，同時也提及台灣過去對於日本地震友好關心、觀光經濟的大力消費，甚至台積電於熊本設廠投資，其中更讓長崎市受益，台灣之於世界的股市、經濟成長率都是「世界不敢忽略」，反觀中國目前正在大力擴張核子武器，威脅世界和平，同時在印太地區軍事演習、製造衝突，都是區域和平的「最大破壞者」，之於長崎和平紀念典禮的訴求「廢除核武」、「追求和平」，聲討對象就是中國，長崎市政府卻扈從中國，貶損追求和平且友好日本的台灣，讓他譴責「遺憾且失望」。
面對台灣方面抗議，根據《朝日新聞》報導，長崎市政府則否認有意矮化台灣，表示今年提供台灣代表的座位與去年相同，均屬於「海外席」，並非刻意將台灣排除在外交使節團之外，市府解釋，日本首相高市早苗及各國駐日大使等人所在區域屬於「特別來賓席」，由於席位數量有限，其他來自海外的公使、參事官及相關人士會被安排至另一處「海外席」，安排沒有降低台灣代表層級或矮化台灣的意圖；長崎市政府甚至同時表示，截至目前尚未收到台灣方面直接提出的正式抗議。
長崎市長被日本網友點名下台。（圖／翻攝自長崎市官網）面對長崎市的回應，日本網友就忍不住跳出來開砲，表示看到長崎市政府的回應「令人感到遺憾」，批評：「如果台灣的抗議屬實，那麼長崎市的回應極為不妥。在倡議和平的儀式上，故意將台灣代表排除在外交使團區域之外，無異於對台灣生存和尊嚴的漠視……」、「又來了，為什麼連日本政府都把台灣視為事實上的國家，而區區一個市長卻還要繼續歧視台灣？」、「市長該下台了吧？」、「你們怎敢這樣對待台灣？台灣可是第一個提供救災援助的國家啊！太丟臉了！」、「對待在包括東日本大地震在內的諸多災難中提供巨大援助的台灣代表，與對待其他國家的外交官區別對待，從禮貌和情感角度來看都顯得不妥。有人認為，地方政府之所以如此體貼，是因為他們了解中國『一個中國』立場，但我認為日本應該優先考慮人道主義和公平……」、「如果長崎市否認台灣的地位，卻優先考慮擁有核武的中國，那麼可以說，它呼籲核裁軍以及提及『三無核原則』已經完全失去了所有可信度。」
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