根據《鏡傳媒》報導，陳建仁說，國產2款國產疫苗都是典型的蛋白質疫苗，需要產生足量的純化蛋白質次單元，因此時程上與國外採取的mRNA平台或腺病毒平台相比，耗時較長。但將腺病毒直接注射到人體內，會導致免疫反應較強的副作用，mRNA疫苗也有蠻多的副作用，蛋白質疫苗通常是對蛋白質過敏的副作用，較腺病毒、mRNA疫苗來得低。
陳建仁認為，台灣現在面臨最大的考驗，就是要不要讓國產疫苗加入施打行列，保護台灣人民的健康；對外界質疑國產疫苗未進入第三期試驗、是否有效等質疑，陳建仁說，目前國產疫苗尚未解盲，外界不必要的揣測並不科學，包括世界衛生組織(WHO)及許多已開發國家的食品藥物管理機構都認同，若要讓疫苗在最短時間內獲得緊急使用授權，可在通過臨床二期試驗後，採取免疫橋接方式證明是否有效，國產疫苗進入臨床二期試驗時，就以3,600人到4,000人的規模進行，而非傳統的300至600人。
陳建仁先前接受民視專訪時，也曾提過台灣必須擁有「自製疫苗」的能力，若未來疫情「流感化」，才會有更多的應對空間，他認為「人類與傳染病的戰爭是永不止息的」。
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