長榮航空2名機師打過2劑疫苗，卻還是確診，其中一人回家還傳染給小孩。而由於跟首例機師都曾飛過芝加哥，指揮中心緊急要求，芝加哥外站返台需居家檢疫14天，並回溯到前14天曾飛過芝加哥航線的組員，通通要召回檢疫，人數估計多達200、300人。另外，長榮航空也證實，芝加哥這個航點即日起，客、貨運航班暫時停飛。

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國內出現機師突破性感染，案「16119」和「16120」，8月30日曾一同執飛澳洲布里斯本航班，由於2人都是正機師，飛行時會交接班坐「同一個位置」，不排除因此相互傳染。而加上先前的機師案「16066」，長榮航空已累積3起機師突破性感染，共通點都是曾飛過芝加哥航班。

桃園市機師職業工會理事長李信燕說，「公司這裡的話從現在開始，芝加哥這條航線就先暫停，就先暫時停飛了，也是我覺得有聽到工會的呼籲，就是我們希望找出問題根源。」

長榮證實芝加哥航線即日起將暫停所有客、貨機航班，恢復時間將視檢疫規範調整再決定。而由於確診的3名機師，都屬「777機隊」，一度傳出為了揪出確診黑數，長榮將針對「777機隊」所有飛行員進行進行PCR檢驗。不過長榮表示，為了進一步檢視機師健康狀況，將擴大針對各機隊飛行員普篩。而在釐清趕感染源前，指揮中心也要求回溯到14天內，8月21日~9月3日曾飛過芝加哥的機組員，都要召回檢疫14天。