對於民進黨團被質疑違法擴權，柯建銘在臉書呼籲，高虹安不要再操作什麼民進黨黑手伸入資策會，「凡走過必留下痕跡，妳應冷靜面對法律面、智財權問題、一職務數行為」，並點出高虹安犯眾怒的原因以及「顯現出不斷跳槽的印記」。
柯建銘質疑，「高虹安身為立法委員，同時也是主審經濟部的經濟委員會委員，不要再硬凹亂講，自曝其短，還想跳槽選市長？」
柯建銘說，第一，資策會是經濟部所屬財團法人，非你所言純私法人，也非如你所比喻的上市公司台積電」；第二，2018年6月通過《財團法人法》，台灣為了國際洗錢防制組織（FATF）規範，及亞太洗錢防制組織（APG）第三輪評鑑而制定相關法規，「我是全程參與修法及協商的人，讓立法院三讀通過。」
至於第三，他說，資策會當年由政府及民間企業共同捐助，雖政府捐助比率38.6%，不超過50%，迴避立法院直接監督。雖預算書不必送立法院，但董監事由經濟部指派，政府有實質控制力，且研究計畫、財務計畫，都要送經濟部、行政院審查通過，委辦、補助經費都送立法院審議，屬《洗錢防制法》、《財團法人法》高規格控管單位，不許有刑法上詐欺、背信、偽造文書等違法事由。
綜合以上，柯建銘痛批，「民進黨黨團行文經濟部、資策會，何錯之有？有違法擴權嗎？不要再操作什麼民進黨黑手伸入資策會，什麼太可怕了，是妳太心虛了吧！」
柯建銘還提到，高虹安身上顯現出不斷跳槽的印記，更是政治史上首創不分區當一半，又空降選新竹市長，讓他感嘆，「為新竹？為柯P選總統墊腳石？對新竹生疏，無感情，靠操作媒體、網紅、聲量難成大器。」
對此，高虹安今（26日）稍早也發聲明駁斥，為自己辯護。高虹安提及，據立法院預算中心報告，政府佔資策會捐助比例為38.61%。資策會是一個政府出資比低於五成的財團法人，所以預決算本來就不屬立院審查的範圍，只需要送營運及資金運用計劃。就連立法院要資料都要走正當程序，更何況不代表立法院的民進黨團？政府也有台積電股份，難道民進黨團可以去函要求交出資料嗎？
她說，從資策會官網上可以看到111年度的資金運用計劃，列出了經濟部以外還有30多個捐助機構，絕大多數都是如永豐餘、台塑、統一、東元、新光紡織、台泥、大同這類純民營私法人，「難道民進黨團可以跳過政府、跳過這些純民營私法人，直接侵害股東權利、要求交付資料？」
最後，高虹安提醒，資策會早年成立的目的，包含推動資通訊基礎建設、資料資訊處理等，其中最重要的，是幫台灣培育資通訊人才，到產業為其所用。怎麼明明是正常不過、甚至被內部譽為典範的事情，不解為何在柯建銘眼裡如此不堪。
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