陽明交大指出，經過審查小組決議成案後，即依本校學倫案件處理要點第五點第一項第三款、第八點第一項第二款及第九點規定，進行實質調查，於111年12月13日本校111年學生學術倫理審議委員會審議，並作成處分決定：學術論文有違反學術倫理情事，違反類型為「抄襲」及未適當引註，依其行為時93年6月23日修枝通過之學位授予法第7-2條及本校學倫案件處理要點第十三點第一項第十一款規定，撤銷其學位，並公告註銷其已頒給之學位證書。
林耕仁選舉期間被檢舉中華大學碩士論文抄襲。中華大學10月26日公布審議結果，經審議委員會決議，認定該論文撰寫過程抄襲行為不成立，但有學術瑕疵。雖然保住中華大學碩論，陽明交大學倫會12月13日審議並作成處分，確定撤銷林耕仁的碩士學位，讓這場政壇論文抄襲風波再添一樁。
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