陳彥元是凱斯西儲大學生命倫理學系博士，美國約翰霍普金斯大學公共衛生學院公共衛生碩士，國立台灣大學醫學院醫學系醫學士，研究領域為急重症醫療倫理、媒體與醫療、學習科學，並多次獲得學術獎項肯定。
陳彥元曾任台大醫學院共同教育暨教師培訓中心共同教育組組長，台北市醫師公會執行長；現職為中華民國醫師公會全國聯合會副秘書長，台大醫學院醫學教育暨生醫倫理研究所教授，台大醫學院附設醫院教學部主治醫師。
其台大醫院同事指出，陳彥元資歷豐富，自台大醫學院畢業後，曾在台大醫院家庭醫學科擔任住院醫師，921地震、2001年桃芝風災重創中部後，曾跟隨台大醫學院教授邱泰源等人，前往鹿谷竹山災區協助醫療重建及社區醫療醫學教育，表現傑出；他也會定時前往台大醫院金山分院看診，頗受好評。
經住院醫師訓練後，陳彥元以公費留考出國進修取得博士，取得博士後回任台大醫學院擔任教職，擔任台大醫院家庭醫學科主治醫師，積極協助推動全人全家全社區的醫學教育，近6年來更積極參與醫師公會的相關工作，擔任5年的台北市醫師公會執行長，以及3年的醫師公會全國聯合會副秘書長，熟悉全國醫界的幹部及基層醫師。
據內部人士表示，台大醫學院院長倪衍玄、台大醫院院長吳明賢極力推薦陳彥元擔任衛生局長一職，正巧陳彥元擔任執行長時，台北市醫師公會與北市衛生局合作推動許多的防疫工作，互動良好，上述經驗都有助他銜接防疫及公衛工作推動，因此受到蔣萬安青睞。
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