指揮中心針對全台捐血人，隨機抽樣監測、COVID-19血清抗體。
但如果不願意提供樣本檢驗，除了要致電疾管署或1922，提供血袋號碼或姓名、生日等個資，引發民眾憂心，個資有外洩疑慮，認為捐血前，就要盡告知義務。
疫情指揮中心發言人羅一鈞說，「（今年）至少到現在已經有通知，2400位的捐血人，那當中目前累計是，只有24位的捐血人選擇退出，每一個都要（捐血前）告知，事實上會延長整個捐血面談的過程，影響捐血的意願等等，徵詢過了一些相關的倫理專家，決定就是說改成用抽樣後，利用前（寄信詢問）的告知模式。」
台大醫院急診醫學部醫師李建璋說，「它的個資或是倫理的風險是相當低，這些資料會集中起來，只會分析他們的盛行率，所以並不會把個人，到底有沒有感染COVID-19，或是其他情況來公布的。」
指揮中心強調，個資不會轉作其他用途。
不過回顧前兩年，相關調查分別抽樣，5千人和3萬6千人，都送過IRB倫理委員會審查，今年的常規監視系統，預計在1到6月抽樣7千人，卻未送審，也引發爭議，是否有違法疑慮。
疫情指揮中心發言人羅一鈞說，「去年跟前年因為它是處於新興傳染病的研究計畫，不過在今年度，因為我們已經有法源依據，所以它已經變成是，公務行政作業的一環，目前來講這個作業系統，本身是合法也合乎規定的，我們禁得起大家的質疑跟挑戰。」
台大醫院急診醫學部醫師李建璋說，「未來如果要變成一個常規的話，或許可以先經過倫理委員會的機制，然後授權這樣的所謂選擇性退出，如果沒有特別表達（拒絕）的話，就是廣泛接受同意的精神，來執行這樣比較大的國家型計畫。」
台大醫師幫CDC緩頰，但也認為相關計畫並非緊急需要，建議還是可送IRB審查，未來學術發表的空間，也比較大。
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