蘇丹內戰爆發，各國紛紛走為上策，日本首相岸田文雄，在4月25日一早，就趕忙向僑民親屬報平安。
日本首相岸田文雄說，「繼昨晚自衛隊飛機載運撤離的45人之外，我們接獲的最新消息是，今日（25日）凌晨，含大使館人員在內的蘇丹日僑，以及親屬共8人已在法國協助下，從蘇丹首都喀土穆北部的空軍基地離境。」
自衛隊先後派出「C2」和「C130運輸機」參加撤僑任務，其中45名日本僑民，在日本時間4月25日凌晨，率先從蘇丹港撤回吉布地，日本政府還貼心的派出醫師問診，確認僑民身體狀況。
NHK主播報導，「根據相關人士消息（首批的）45人，是從蘇丹首都喀土穆出發，分為數隊從陸路前往機場，目的地是紅海邊的港灣城市蘇丹港，NHK主播距離比東京到廣島還遠約700公里。」
數百名各國民眾，蜂擁進入蘇丹港，要撤離這個是非之地。許多僑民都是歷經長達數百公里的大逃亡，才能歷劫歸來。
撤離蘇丹日僑川原尚行說，「多虧自衛隊、外務省、大使館，以及JICA的人員相當感謝他們。」
蘇丹原本有許多日本NPO團體，負責提供醫療和生活援助，隨著戰亂興起卻不得不撤離當地。
蘇丹的日本大使館也一度關閉，改在吉布地設立臨時事務所，外務省更對蘇丹全境發布旅遊警示，呼籲日本民眾不要前往當地。
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