有媒體爆出一份電子郵件並指出，從電子郵件的時間（2021年6月16日），再比照郭台銘於2021年6月18日透過臉書指控「民進黨派系」涉入擋疫苗，就可以知道郭台銘早在發臉書文章之前2天，就已明確知道，「BNT不賣疫苗給私人部門」。
對此，郭台銘辦公室聲明指出，信件內容明確提到，民進黨因堅持與BioNTech的協議對外公告時必須寫「獨立的台灣政府」(Independent Government of Taiwan)，由於代理商Fosun（中國上海復星製藥）無法接受，交易被迫取消。合約取消是因為民進黨政府堅持將政治置於人民生命之上。
郭台銘辦公室認為，固然民進黨政府因為名稱問題，不斷漠視人民迫切需要，一再拖延，但郭台銘先生仍然多次與政府溝通，用盡全力希望儘速協助採購國際認證的優良疫苗讓人民能夠施打。疫苗是醫療產品，郭台銘要採購，當然要取得政府的授權與同意，然而過程當中政府再三的技術性拖延。
郭台銘辦公室表示，合約取消是因為民進黨政府堅持將政治置於人民生命之上。照理來說政府為了人民的健康，要比任何人還急，令人遺憾的是，我們的政府把意識形態看得比人命更重要，「我們會開始準備詳細資料，事實會證明一切」。
疾管署今日深夜則提出2點聲明，首先，我政府於2021年1月與德國BNT公司所洽定的採購合約中，簽署代表為Taiwan Centers for Disease Control, Ministry of Health and Welfare, the Representative Agency of the Republic of China （Taiwan） （衛生福利部疾病管制署），並沒有要求使用Independent Government of Taiwan等文字，絕無意識形態考量。衛福部將在不違反保密條款為前提，揭露契約書上我方已簽署的抬頭欄位，以正視聽。
第二、衛福部與指揮中心之前已多次說明與BNT就訊息公開部分溝通的完整經過，2021年1月8日合約簽署最終階段，德國BNT公司以電郵要求我方刪除「中文」新聞稿提到「我國」之文字，隔日我方就將中文新聞稿提到「我國」的部分改為「台灣」，將更新版本電郵寄送德國BNT 公司，之後便無疾而終，此即印證有政治外力影響合約簽署。
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