沿著海岸跑步，行經澎湖的著名景點，有漁翁島燈塔、牛心灣、大菓葉柱狀玄武岩、再經跨海大橋抵達通梁古榕等景點。
另外，賽道沿線還設置特色補給站，提供澎湖在地的美食像是大龍蝦、緝馬灣花枝，還有海鮮粥，「一年一度的菊島澎湖跨海馬拉松」，將在今年11月5日起跑。
除了FubonAngels的三位啦啦隊成員秀秀子、Jessy、蓁蓁，今年會到現場為選手加油打氣，還有來自荷蘭的路跑選手何韻柔，擔任活動大使。她之前去過澎湖參加鐵人三項比賽，對澎湖美景及美食，印象深刻。
路跑好手何韻柔說，「我們荷蘭也是風很多，所以那時候騎腳踏車，逆風很大，有一種回家的感覺成績的部分，希望順順的跑完就好，還是希望兩個小時內跑完，吃的部分， 當然是要吃到龍蝦然後，很喜歡的是仙人掌冰。」
菊島澎湖跨海馬拉松，具備IAAF/AIMS國際專業賽道認證，是國內唯一的跨海、跳島馬拉松。
今年（2023年）分為42K、21K及5K、42K全馬接力組，還首度增加了體驗組11K，推出全新賽道及路線規劃。
澎湖國家風景區管理處許宗民說，「我們很棒的親子可以去參與的馬拉松，就是5K的休閒組跟11K的體驗組， 最棒的是我們有很漂亮的海岸線，我們在跑經過跨海大橋的時候，都是所有跑者認為最大挑戰的地方，但是跑完跨海大橋大家一定會覺得畢生難忘。」
報名期限至2023年9月30日，邀請跑者不畏風澎湖的10級陣風逆風而跑，挑戰自我極限。
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