台灣高鐵表示，其於地震發生第一時間成立緊急應變中心（EOC）進行地震應變，由於此次災害告警系統（DWS）測得最大254gal之讀數，已達第3級警戒標準；依標準作業程序，高鐵公司已即安排軌道、電力及土木維修人員執行地面巡檢，將於確認設施及結構安全後，授權列車以注意進行方式（時速45公里）運轉，並持續檢測列車及軌道搖晃情形，後續將依時速70公里、120公里、170公里、230公里之順序，漸進提升運轉速度，於晚間20時37分全線恢復正常運轉。
受此地震事件影響，致部分列車有所延誤，台灣高鐵公司已於各車站增派人力，並於車站及列車加強對旅客廣播，說明延遲情形，同時提供麵包及礦泉水供旅客取用。台灣高鐵另於晚間6時55分加開1班次台中站發車之全車自由座（商務車廂除外）北上列車，以紓解台中站北上搭車人潮。
受地震影響之旅客相關退費及退票規定說明如下：
1.地震屬天然災害，非可歸責高鐵公司，故不適用延遲退費之規定。
2.凡購買因地震影響之車次，若車票未經使用，旅客可自原乘車日起一年內，持原車票至各車站售票口辦理退票，免收手續費。
台鐵局則表示，嘉義沿線警報器偵測到震度4級震度，因此花壇=善化間按4級地震規定辦理，目前行經該區間列車有延誤情況。偵測到4級、5弱地震後，第一趟列車以30K/H，第二趟列車起以60K/H慢行至前方站。另需由工、電單位派員巡查路線，無礙後，才恢復原速度。
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