在被問及相關預算的問題時，莊人祥表示，這項措施將透過兩階段的篩檢方式，將每人每次檢驗的成本控制在約6千元左右。初步估算顯示，每周的總花費將約為18萬元。
為了更有效地監控中國呼吸道疾病疫情，疾管署於11月26日起在台北、桃園、台中及高雄等四個國際機場實施「定點監測 鼓勵採檢」措施。這項措施將針對自中港澳入境的有症狀（類流感）旅客提供免費的採檢服務，其中包含對17種病毒及4種細菌進行檢驗，如流感病毒、新冠病毒、鼻病毒、肺炎黴漿菌、腺病毒、人類間質肺炎病毒等。這項採檢是鼓勵性質的，而非強制性的。
莊人祥指出，檢測的費用約為6千元，將透過兩階段的方式進行。首先，在第一階段，專注於檢測比較普遍的流行疾病，例如流感、腺病毒和呼吸道融合病毒。若在此階段未發現病原體，則轉入第二階段，此階段的檢測較為耗費成本，然而這樣的設計旨在最大限度地控制花費，以確保每次檢測的成本維持在約6千元。
莊人祥進行了整體預算和檢測量之間的相關性分析，指出入境旅客中約有千分之一可能出現發燒症狀。在進一步了解採檢意願的情況下，目前每天約有5到10人願意接受採檢。相關經費將由疾管署負擔，由於牽涉跨年度的考量，預計到明年1月經費將更為充足。至於年底前的預算調整，莊人祥指出每周的花費約為18萬元，目前仍能負擔。
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