徐巧芯質疑台灣與捷克援助烏克蘭專案，因此對外公布部分文件，挨告違反《刑法》洩密罪，但徐反擊稱，捷克外交部國際期刊早在3月26日就已揭露相關資料，不應該是密件。
台灣與捷克的國旗。（合成圖／翻攝自外交部社群平台X）對此，外交部昨日深夜發出新聞稿澄清，捷克外交部期刊於今年3月底專文刊出合作案部分要點，其目的是在彰顯兩國合作援助烏克蘭之美意，但是兩國政府不曾將雙方簽署的備忘錄約文對外公開。雙方政府原即規畫將合作內容與進度適時適度對外說明，但並非公布約本。此與我內部公文密等之核定、變更或解密無關，亦不應以此合理化立委的洩密行為。
外交部強調，本案公文文書雖基於外交考量列為密等，但是全案仍循公開、透明原則，遵照《條約締結法》規定，於簽約前報請行政院核定，並於簽約後分別報請行政院及立法院備查，提供立法院委員參考。
外交部指出，徐巧芯在收到外交部送立法院備查之備忘錄約文後，倘有疑義，可請外交部派員說明，或如諸多朝野資深立委所說，以召開「秘密會議」方式處理，而非視機密保護於無物，逕自在媒體面前公開列密文件，藉以博取聲量和轉移輿論對其關注焦點，甚至傷害我國與友好國家間的互信合作關係。
另，針對外界質疑，台捷合作援烏案為什麼不請烏方提供需求清單，由我國直接採購交付，要透過捷克轉手，是否為了規避《政府採購法》，或者意圖使第三方從中獲利？
外交部嚴正澄清，烏克蘭東部為戰爭前線最危險、醫院遭炮火摧毀最嚴重的地區，烏國人民極為需要初級醫療照護。考量到台烏之間尚未建立正式官方關係，我國進入戰地實地瞭解醫院需求並進行採購有實際上的困難，政府因此與捷克政府簽署瞭解合作備忘錄，由捷方依據烏克蘭當地所需，指派有專業、有能力進入烏國執行醫療計畫的非營利組織「捷克衛生科技院」作為執行機構。
對於烏克蘭戰地可援助形式，外交部表示，由於戰區各醫院醫療設備與用品的需求不同，且採購上具備時效性，基於外交與醫療專業上的信任，所以我方給予捷方規劃採購上的彈性，且亦回應立法院要求，指定部分須向台灣製造商採購，創造台灣商機。
外交部重申，捷方採購程序，除依據捷方本身對非營利組織的內部治理及外部監督法規外，捷克亦為歐盟成員國，歐盟對非營利組織及援助烏克蘭二者亦訂有高標準規範，且捷方執行結果必須向雙方政府提交報告，接受監督，所謂規避《採購法》或意圖令特定第三方獲利等說法，既非事實也毫無根據。
此外，「捷克衛生科技院」是獲得捷克外交部、衛生部及工商部支持的單位，負責執行兩國合作計畫，並非是徐巧芯指稱的私人公司；徐委員的說法明顯不符事實、混淆視聽。
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