案發前兩天，林士傑到全台開基永華宮參拜畫面曝光。（圖／翻攝畫面）就在命案發生前兩天，林士傑還獨自一個人，來到自己曾經擔任過主委的安平永華宮參拜，廟方說，他過去幾乎每天都會來，對於廟務也是大力幫忙，但幾乎沒他聽談起與人有過恩怨。
全台開基永華宮主委楊宗保：「他來我們廟裡他一個原則，就是廟就是廟單純，所以他不要讓廟去碰到一些其他的，所以他都沒有跟我們說到其他的事情。」
要追出命案細節，檢警持續抽絲剝繭找線索，週二（9日）一早，不但將林士傑的遺體送到高雄做斷層掃描，下午再回到台南做解剖，希望能找出蛛絲馬跡。
台南地檢署襄閱主任檢察官蔡宗聖：「就林姓死者進行電腦斷層掃描，發現部分子彈仍在死者體內，將由法醫師在台南市立殯儀館，進行解剖鑑定及槍創彈道比對。」
9日下午，法醫在台南殯儀館解剖相驗。（圖／民視新聞）另一方面，也要持續追查兇手下落，不只週一（8日）循線找到做案車輛及兩把槍枝，全都遭到縱火焚毀，9日又在高雄大樹，追出第二部做案車輛，但內部同樣遭到鹽酸損毀，不過從動向研判，歹徒可能往南邊逃離，緊盯所有可能的偷渡管道。
台南市警察局長廖宗山：「我們一開始就透過包括各個港口，我們透過海巡還有機場，我們希望他們幫我們注意可疑的人事物。」
但如此縝密犯案，歹徒恐怕早已光明正大離境，而做案動機，傳聞有人想走私大量物品到安平，尋求林士傑協助遭到拒絕，也有另一說是私人恩怨導致，背後原因，眾說紛紜。
警方在被燒毀的做案車輛中，找到被燒到碳化的第二把手槍。（圖／民視新聞）台南市刑大大隊長張文源：「這些線索我們昨天（8日）就有接獲到，我們都有納入在做調查，但是就是證據的直接串聯，我們還是要講證據。」
林士傑友人：「賄選案之後他就已經在淡出了，不管是要去場合、要吃飯他都不會去，在我們這一兩年來，我們是沒有，有這種他在抱怨什麼，或是說有跟誰怎麼樣。」
不過熟悉林士傑的朋友強調，在議長賄選案後，他幾乎不過問外界事務，到底為何釀出殺機，各界也都想知道。
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