台南市府首先指出，陳椒華的指控不符事實，今（30）日予以嚴正澄清，相關案件均由權責機關，依規定辦理現場勘查、行政查處及後續追蹤，對查有違法事實者依法裁罰，甚至移送司法偵辦。因此，絕非陳椒華所稱放任或包庇。市府也表示，對於缺乏具體事證的包庇圖利指控，必須表達嚴正駁斥，並強調市府依法行政，絕不縱容違法開發。
水利局說明，白河水庫周邊山坡地管理均依法辦理，針對民眾檢舉及通報案件，均已進行現場勘查及必要行政處分。例如關子嶺段89-45、89-19地號，曾因違反《水土保持法》遭裁罰15萬元，後續施工又發現超出核定範圍堆置土方，再次裁罰10萬元；另，關子嶺段223-3地號也已依法裁罰8萬元，並追蹤確認限期改正事項。綜上所述，水利局說，相關案件均有明確查處紀錄，足以證明市府並未放任違規行為。
水利局進一步指，針對大凍山步道周邊部分土地，出現植被清除及地表裸露情形，也已要求水土保持義務人，得限期恢復植生覆蓋，並持續追蹤改善情形。而對於違反水土保持法令者，也將依法裁處，必要時要求停工及採取相關處置，確保山坡地安全及水土保持功能。
台南市政府。（圖／翻攝Google Maps）環保局則表示，針對外界關切的污水排放及水質污染疑慮，均依《水污染防治法》相關規定辦理查核。關子嶺段223-3地號經檢視現有設施，尚未達飲用水水源水質保護區內餐飲業列管條件；另，223-4地號已派員稽查，惟因現場未營業，尚待進一步確認實際座位數及作業面積。環保局承諾，將儘速再次前往稽查，釐清是否符合列管條件、以及有無違反水污染防治相關規定，若查有違法情事，將依法處理，絕不寬貸。
另一方面，針對外界關切農業局補助道路工程，農業局也嚴正澄清，相關農路修繕，均有依據「台南市政府農業局辦理農路修繕審查作業要點」辦理。包括關子嶺段94-7等地號排水改善工程、以及關子嶺段30-102等地號農路改善工程，均非新闢農路，更非修繕私人專用道路，而是針對既有農路及排水設施進行改善，主要目的在於維護農民農產運輸、登山民眾通行及豪雨期間排水安全，具有公共使用及安全維護的必要性。
農業局強調，相關工程均依規定辦理審查，並非為特定私人開發案提供便利，不應將公共設施改善、與私人土地開發行為混為一談，更不應據此逕行指控市府圖利特定業者。台南市政府也說，不應在缺乏具體證據的情況下，將兩者逕行畫上等號，造成社會誤解。
最後，市府表示，維護水源環境及山坡地安全，是市府責無旁貸的工作；對於違規開發，市府絕不護短、絕不寬貸，之後也將持續透過跨局處聯合稽查、衛星監測及現場巡查，落實山坡地管理，確保水源安全與環境永續。
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