對此台大名譽教授賀德芬在臉書發文抗議，甚至以鮮紅色的圖案，寫上大大的「國恥日」，還嗆說要罷免蔡英文。
社會民主黨黨主席范雲也在臉書開砲，直指大學自主、大學自治根本沒贏，教育部與台大都輸了。更說，「只有選舉的贏家，才真正大贏啊！」也質疑民進黨選後將轉型正義「大拍賣」。
台灣社、台灣北社、台灣南社、台灣東社（花蓮）、台灣東社（台東）、台灣客社、台灣教師聯盟等民間團體晚間也發出共同聲明表示，完全無法接受此一不合法、更不合理的重大決策。
共同聲明指出，台大校長遴選其中過程發現太多違法與瑕疵情節，23日桃園市長鄭文燦也表明補正瑕疵，重啓遴選機制，讓利害關係者迴避。聯合聲明質疑，教育部長葉俊榮讓管中閔上任，「黑幕下掩蓋了怎樣的故事？」
民間團體指控葉俊榮擅專越權，質疑他怎能續留閣員？並嚴正要求葉俊榮立即下台。
總統府發言人林鶴明則表示，針對台大校長遴選案，總統府對於此案的一貫的立場就是由教育部依照權責辦理。
林鶴明表示，今日午後，行政院長賴清德向總統報告，剛剛接獲教育部告知對於台大校長遴選案的決定。賴清德認為本案事關重大，希望教育部審慎思考，相關決定也應向社會清楚說明。對此，總統也尊重行政院對本案的態度。
（民視新聞網／曾雅凰 綜合報導）
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