又爆出特權打疫苗嗎？有基層海巡人員在網路上PO文，說原本要給台中海巡基層人員施打的疫苗，被署本部、各科室、巡防區的長官占用，先拿去打了，讓他們抱怨，自己是海上孤兒，對此，海巡署澄清，是各單位遞交名冊有時間差，引發誤會，還沒打疫苗的同仁，都已經安排施打。

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海難現場，或是外籍漁船闖入我國海域，都能看見一線海巡人員衝鋒陷陣，疫情當前，他們也是疫苗的主要施打對象，但沒想到。

民視記者李豫翰報導，「疫情指揮中心將保家衛國的軍人，設置為疫苗施打類別的第二類，但中部確有海巡基層人員跳出來爆料，原本應該屬於他們打的疫苗，不但通通打不到還被高層搶去打。」有第一線海巡人員踢爆，5月21日中部海巡隊彙整名單交給分署，6月4日分署函報衛生局，6月14日分配到543位疫苗施打施打人數，原先是要配發給第一線海巡人員施打，結果屬於第七類的海巡署本部、各科室、巡防區長官紛紛搶打，說自己的疫苗自己找醫院打，根本是海上孤兒。

其他海巡基層人員說，「海巡第一線基層人員滿容易接觸到，比如說外籍漁工，有時甚至會做一些登船檢查的動作，都會有一些風險，如果有疫苗對他們保護力會比較好。」

艦隊分署副分署長吳金河表示，「惟因海巡隊遞交名冊時間較晚，衛生單位依照名冊順序核列，兩梯次疫苗施打時間，並非刻意排除海巡隊。」海巡澄清一切都是誤會，強調沒有官員插隊問題，是造冊上時間有耽誤，海巡隊6月10日才委託分署代為申請，隔天給出名冊，總共有907位同仁，第一批543劑不夠用，導致官員跟內勤人員，壓縮到一線人員名額，絕無刻意排除。