監院曾糾正北市府的「社子島案」,查案監委趙永清一度要行使質問權,把台北市長柯文哲找來監察院說明。但傳出監察院長陳菊在委員會當場提醒,質問直轄市首長,程序完備很重要,讓整件事踩煞車。對此,趙永清澄清,當初是發現缺乏完整調查文件,調查人員也退休,才會讓整件事情延宕。而陳菊通常也不會對調查案件過問。