苗博雅在臉書指出，台北市政府已經公告下週一開始施打兒童莫德納疫苗，也已經讓家長知道，並完成意願調查。願意讓孩子打莫德納的家長，都已經有明確的預期，她進一步強調，輝瑞兒童疫苗預估最快五月中抵台，加上檢驗封緘、配送，或者貨運稍有延遲，可能要六月初才能真正施打。她質疑，如果各縣市都按部就班推動兒童疫苗施打，難道台北市有意願打莫德納的家長和孩子，難道得為了配合尚未確定何時抵達的輝瑞疫苗「空等一個月？」。
針對蔡炳坤的言論，苗博雅批評「本市負責規劃疫苗施打政策的官員，有這種草率的言論，非常不恰當，會引發家長的憂慮」，另外，對於台北市長柯文哲預言台灣會「天下大亂」，她也開酸「柯文哲連帶著市府從上到下，講話前不想清楚，戰略矛盾、戰術混亂。這個天下大亂難道真是自我實現的預言？」。
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