國民黨議員王鴻薇爆料林智堅2008年的中華大學碩士論文「以TCSI模式評估國內某科學園區之週邊居民滿意度」抄襲，和新竹科學園區2008年發表的期末報告書題目有許多地方雷同。另外，林智堅在台大國發所的論文也爆出抄襲，論文「摘要」和另一位也是時任教授陳明通指導的碩士余正煌有70%一樣，研究概念和研究方法高達88%雷同。
林智堅先前已召開記者會澄清，不過國民黨仍持續猛攻，並向中華大學和台大提出檢舉，兩校皆已表示收到檢舉，將用2個月調查。
柯文哲今受訪時被問及，林智堅選情是否受影響？他認為，既然事情鬧到這麼大．「我做為台大教授有個建議，台大一定要組織獨立的論文審查委員會，在2個月給事情完整調查，台灣大學禁不起摧殘」。
柯文哲表示，台灣大學發的碩博士論文如有抄襲造假，有時候他們也沒時間仔細詳查，「陳明通到底是掛名173名學生，還是指導173人？」像他自己也當過口試委員，但在55歲前上班超過12小時，可掛名指導的學生恐不到10個，陳明通能到170個怎麼這麼厲害。
柯文哲強調，台大還是要面對事實，「這個出問題，台大校譽就全毀了」。當年他的學長楊泮池也是掛個名，結果校長職務就被逼退了，他重申，堅決要求要組織委員會查個水落石出，不能放任謠言滿天飛，如果是要處理，不是也要還人家清白。
（民視新聞網／綜合報導）
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