媒體報導指出，漁業署4月核定高雄離岸約12海浬處海域，開放珊瑚漁船探勘海下的寶石珊瑚，未來可供採集，範圍約1358.76平方公里，與台南、高雄、澎湖漁民俗稱的「高雄西」傳統漁場重疊，漁民痛批漁業署事先未溝通，憂心珊瑚船作業破壞珊瑚礁，影響海洋生態，罔顧漁民生計。
漁業署今日以新聞稿回應表示，寶石珊瑚漁業漁區調整應以科學調查研究為本，目前不會調整。漁業署為了寶石珊瑚漁業資管理，98年1月16日訂定「漁船兼營珊瑚漁業管理辦法」，採「嚴審、嚴管、做好科學研究」之管理原則，以原先有經營的60艘漁船為許可上限、指定5處作業漁區及3處指定漁港進出、年度總漁獲量6公噸、裝設船位回報器、卸魚申報及配合觀察員執行科學觀察等規定。112年共核准58艘漁船作業，近5年平均漁獲量2公噸。
漁業署說明，為研究漁區調整與輪作，分別於110年及111年邀集產官學召開2次會議，一致認同漁場應休息輪替，漁區調整應以科學研究調查為基礎，完成調查後結合輪作規劃再予評估漁區調整事宜。
漁業署表示，因此自今年起，從過去的傳統寶石珊瑚漁區中，選擇台灣西南12浬外海域進行試驗作業，每艘試驗漁船皆搭載觀察員執行科學調查，截至112年6月22日已完成三組試驗，並已暫停探勘試驗，後續該署將邀集產官學共同討論三組探勘試驗結果。
漁業署進一步說明，寶石珊瑚分布在水深100公尺以深之海山地形環境，與分布於沿岸50公尺以淺海域造礁珊瑚不同。漁船捕撈寶石珊瑚，以紅珊瑚科之桃紅珊瑚（Momo）、赤紅珊瑚（Aka）、白珊瑚（Shiro）及粉紅珊瑚（Miss）等4種深海珊瑚為主要漁獲目標。
而寶石珊瑚生長於水下100公尺以深之海山環境，陽光無法穿透到達低，周圍生物多樣性相對較低，漁船係以繩索綁附沉石與網片，配合海流方向定點作業，尋找生長在海山地形上之寶石珊瑚，作業深度超過100公尺，並非用拖網作業，不會影響淺海造礁珊瑚。
漁業署最後表示，寶石珊瑚漁區調整應以科學研究調查為基礎，在科學研究未有結果及與外界溝通前，不會調整珊瑚漁區。
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