健保署公布的227家院所財務報告中,有19家醫學中心、81家區域醫院、124家地區醫院與3家基層診所,健保署表示,過去8年以來,符合提報財報的醫療院所,醫務收支有結餘的家數占率約在68%至78%,整體收支有結餘的家數占率為84%至91%間。而依整體結餘排名前5大醫院,依序為第1名林口長庚醫院43.47億元、第2名高雄長庚醫院41.57億元、第3名中國附醫22.14億元、第4名台大醫院19.93億元、第5名桃園長庚醫院16.36億元。另外,診所盈餘前三名分別是第1名書田診所、第2名遠東聯合診所0.78億、第3名安慎診所0.09億。
儘管長庚醫院體系佔據最賺錢排行前5名,但賠錢的醫院前10名中,最賠錢的前二名是嘉義長庚醫院(虧損10.33億元)和長庚醫院經營的新北市立土城醫院(5.63億元),另外,土城醫院、輔大醫院、台大癌醫與臺大生醫4家醫院在財報公佈當時成立尚未滿4年。
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