2008年11月，因涉嫌國務機要費洗錢案，逃往美國的前新光醫院副院長、陳水扁家親信黃芳彥，傳出4、5天前，在美國加州過世，陳屍自家車內。消息已經獲得台中開診所的弟弟黃重彥證實。前總統陳水扁也在死訊傳出當天(1/29)深夜，發文哀悼，表示1月16日黃芳彥才打電話，對母親的過世表達哀悼與慰問之意，「不過12天就聽到黃醫師的死訊，簡直沒辦法相信這是真的」。
陳水扁更回顧17年前SARS，黃芳彥自告奮勇，要以生命住進國軍807總醫院的專責醫院，全天候陪同醫護人員，同生共死，還寫好遺囑、交待後事，陳水扁感嘆地說「2003年有很多出名的抗煞英雄，黃芳彥醫師絕對是非常重要的，功成不居「無名」英雄！」
陳水扁以「抗煞無名英雄黃芳彥醫師」為題哀悼黃芳彥，回想起2003年抗煞期間，當台北市和平醫院在4月24日封院後，黃醫師跑到玉山官邸告訴他，報告封院是不對的，建請總統站出來召開國安高層會議才能有效解決。
也轉述當時的三軍總醫院院長陳宏一，回憶黃芳彥在和平醫院封院後的關鍵36小時中，如何和府方、醫院方合作。
4月25日，行政院應變會議召開前，黃醫師邀請國防部副部長林中斌和三總陳宏一院長了解，三總成立專責醫院的可能性。經協調後改由國軍807總醫院成立專責醫院。
4月26日，三總陳院長正式在國軍807總醫院成立專責醫院準備收治隔離和平醫院轉出之確診病患，一人一床。同時協調北部除台大以外的其他醫學中心，各出1個醫師6個護理人員，主治醫師及排班由三總負責。黃醫師在協調溝通有了共識結論後，防疫如作戰，特別到官邸報告並籲請總統連夜召開國安高層會議。
4月26日，當天晚上10點多，阿扁在總統府召開國安高層會議，經過冗長的討論後形成共識，約在隔日凌晨二時，由總統裁示抗煞36小時大作戰，要把被封院的和平醫院重大確診病患，轉送國軍807總醫院收治隔離。
4月27日，第一批和平醫院的10多位重大確診病患完成轉送。
當36小時抗煞大作戰完成後，為了安撫心有疑慮的醫護人員，黃芳彥醫師自告奮勇地說，他要以生命住進國軍807總醫院的專責醫院，全天候陪同醫護人員，同生共死，直到疫情解除。黃醫師同時寫好遺囑，交待後事。
（陳水扁 2021.1.28）
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