全台目前至少5家醫院爆出院內感染，像衛福部花蓮醫院累積16例，宣布暫停門、急診以及病患出院。新北的雙和醫院，也有5名急診醫護確診。加上職場接觸者得匡列隔離，陳時中坦言，目前最擔憂的就是醫療崩潰，因為將會帶很大的傷害。台大醫師李秉穎則建議，可以放寬完整接種疫苗的密切接觸醫護，如果沒症狀，隔離縮短到一週即可。

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週四（4月14日）上午，衛福部花蓮醫院大陣仗，全院採檢，因為連續爆出院內感染，門急診都暫停，住院患者也暫停出院。衛福部花蓮醫院院長楊南屏說，「到昨天全院普篩，總共完成了360位員工，總共有35位確診，還有8位報告還沒有出來，還有1位重新採檢，另外還有16位，要召回做後續採檢。」

統計到週四（4月14日）為止，累積16例確診，包括3名護理師染疫，還有許多陽性確診沒有列案號。慈濟醫院內也有10名醫護確診，新北的雙和醫院急診，也發生1傳4，共5位醫護染疫；彰化二林基督教醫院，則有6名護理師確診，高雄長庚1名內科醫師，休完假返院確診，初步判斷可能是社區感染。

全台五家醫院爆出院內感染，接觸的醫護也得匡列隔離。要是疫情持續升溫，醫療體系恐怕不是人力吃緊這麼簡單。疫情指揮中心指揮官陳時中說，「這段時間，在這種高傳播的情況下，我們就怕醫療崩潰，會帶來最大的傷害。」台大醫院醫師李秉穎說，「如果是打過疫苗，有免疫力了以後，身體裡面有病毒，排泄時間會短很多，對於這種打過疫苗，無症狀感染或是輕症感染的話，他的檢疫時間可能可以縮短。」