本次涉及輸入原料的《大醫生技》貼出聲明，健字號紅麴膠囊已第一時間預防下架、停止供貨，但強調每批產品皆有未檢出各項有害物質；三合興產業也呼籲客戶，停止銷售已製成品，並盡速將原料收回。消息曝光後許多人詢問潘子明教授「紅麴這麼危險嗎？」、「我們吃紅麴一直很有效那現在要怎樣選產品？」，他表示，小林製藥紅麴事件原因還未查明，無法得知為何導致這麼多人就醫，但可以從以下4個步驟來檢視自己所吃的紅麴：
1.辨識紅麴成份來源
這次出問題的是日本小林製藥公司，很多進口日本小林製藥原料的廠商，第一時間都已經下架，如果可以選擇全程在台灣GMP廠製造的紅麴，相對在政府的監管下能更被充分掌控。
2.提問相關檢測報告
紅麴發酵原料是白米粒，衛福部在糧食規範上要檢測黃麴毒素、赭麴毒素等，業者是否能有效控制？是否有遵照法規定期送驗？檢驗單位是否具公信力？從源頭原料的挑選就做好掌控，可降低很多風險。
3.詳看製程管制措施
真菌類發酵代謝出來的東西有好有壞，好的二次代謝產物可以提供健康各種指標調節的效果，例如Monascin、Ankaflavin等黃色色素，但也有不好的東西如「橘黴素」。可詢問製造廠商如何透過製程管制點來有效嚴格監控，確保最終產出的原料或產品安全合規。
4.依循國際、國內認證規範
台灣健康食品認證分成一軌和二軌，一軌認證是經過連串的嚴格審查，包括安全性、安定性到功效性試驗，能通過審查取得認證的產品，在不該有的病原菌或總生菌數控制上都有嚴格規範，才能確保正確存放時不會變質，同時功效成分的含量和安定性也被嚴格要求與規範；這些都是二軌健康食品認證沒有的流程。
另外，美國FDA也有完整的安全性評價申報體系，從一般食品添加物認證的GRAS到膳食補充劑的NDI，都嚴格審查、把關，所以挑選時可參考原料或產品，是否有上述衛福部健康食品一軌認證，或國際FDA相關的GRAS或NDI認證。
娘家保健生技則指出，旗下產品「娘家大紅麴膠囊」、「娘家大紅麴燕麥片」，內含成分「ANKASCIN 568-R」（安可信心），發酵源頭精選100%契作台灣米，並使用獨家專利固態發酵製程，在台灣自設發酵廠並全程自製生產，無外購添加其他紅麴原料，每批紅麴原料均經自主檢驗，符合國家標準安全無虞。另外娘家大紅麴不含可能傷肝腎及和藥物產生交互作用的莫納可林K（Monacolin K），為美國FDA唯一核可上市紅麴，同時也是市面上紅麴產品中，唯一獲得健康食品三功效的國家認證，可調節血脂、調節血糖、延緩衰老。
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