總統府網站上的國旗圖樣，因為與制式的比例不同，被藍營拿出來做文章。國民黨中央動員台北市國民黨議員，緊咬總統府違反國旗法，要求柯市府糾正總統府。不過綠營反嗆藍軍，不懂網頁設計的創意，總統府更是懶得回應。